Sean Huizinga voert regelmatig onderzoek naar bouwhistorische onderwerpen. Zo heeft hij verschillende bouwhistorische onderzoeken gedaan van gebouwen, een onderzoek naar de eerste Nederlandse productiekeukens door de firma Bruynzeel, heeft hij een publicatie geschreven over het Oude Raadhuis in Oud-Beijerland en een boek geschreven over bungalows in Nederland.
Hiernaast werkt Sean Huizinga regelmatig als onderzoeker voor externe partijen waar hij onderzoek doet naar (modern) erfgoed en architectuur.